染色体缺失胎儿是否可以保留，主要取决于染色体异常的严重程度，首先如果是大片段的缺失，比如某一条染色体或者缺失某一条染色体上的很大一部分片段，这种情况往往会导致严重的畸形，一般是不建议保留胎儿。

其次如果是染色体微缺失，而且通过父母双方检测发现胎儿的缺失与夫妻双方的缺失是一样的，父母表现为正常人，那么可以推测胎儿也是正常的，这种情况是可以保留胎儿的，如果夫妻染色体正常，则需要在染色体缺失数据库查询，发现这种缺失情况有无有致病性，无致病性也是可以保留胎儿的。

不过对于绝大多数女性来说，往往建议终止妊娠，因为这其中赌的成分很大，并且需要靠运气，强行剩下孩子只会苦了孩子，拖累家庭，所以请谨慎考虑。