做试管婴儿助孕的最后一个步骤是把胚胎轻轻地放入子宫内举例宫腔底1~2厘米处。但是移植到子宫内的胚胎不是马上着床的，它会在子宫内游走，离开放置的区域，另外在子宫内膜上寻找合适的地方着床。如果恰巧胚胎游走到输卵管，又恰巧女方输卵管有不通畅、出血、粘连等情况，让胚胎可进不可出，这就迫使胚胎在输卵管种植，宫外孕就发生了。

试管婴儿助孕后的宫外孕与输卵管引起的不孕、腹腔及宫腔手术、此前宫外孕手术史及感染史有关。吸烟、既往宫外孕史、上过环、盆腔或腹部手术史、多次妊娠以及多个性伴侣都是危险因素，这些都会增加发生宫外孕的概率。